Mrkvičková, M., Kožín, R., Hanel, M., Beran, A., Brabec, J., Novický, O., Fridrichová, R. Navrhování adaptačních opatření pro snižování dopadů klimatické změny na hydrologickou bilanci v ČR. Praha : Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka, v.v.i., 2012, 133 s., ISBN 978-80-87402-25-2.

Novický, O.,Vyskoč, P., Vizina, A., Kašpárek, L., Picek, J. Klimatická změna a vodní zdroje v povodí Vltavy. Praha : VÚV T.G.M.,v.v.i., 2008, 29 s., ISBN 978-80-85900-79-8.

Tušil, P., Vyskoč, P., Kodeš, V, Němejcová, D., Borovec, J. Doporučení pro optimalizaci procesu hodnocení stavu povrchových vod pro 3. plány povodí. In . ČVTVHS Novotného lávka, Praha, 21. 3. 2018. : , 2018, s. . ISBN .

Tušil, P., Vyskoč, P., Kodeš, V, Němejcová, D., Borovec, J. Doporučení pro optimalizaci procesu hodnocení stavu povrchových vod pro 3. plány povodí. In VÚV TGM, v.v.i. . ČVTVHS Novotné lávka, Praha, 21. 3. 2018. Praha : , 2018, s. . ISBN .

Adam Beran, Martin Hanel, Magdalena Nesládková, Adam Vizina, Petr Vyskoč Changes in water balance in Western Bohemia and options for adaptation. In Geophysical Research Abstracts, Vol. 20, EGU2018-12878, 2018. Vídeň, Rakousko, 8. 4. 2018. : , 2018, s. . ISBN .

Balvín, P., Vyskoč, P., Rosendorf, P., Kult, A. Novelizace vodního zákona - stanovení minimálních zůstatkových průtoků. In VRV a.s. Vodní toky 2010. Hradec Králové, 30. 11. 2010. Kostelec nad Černými lesy : Lesnická práce s.r.o., 2010, s. 42-47. ISBN 978-80-87154-51-9.

NOVICKÝ ,O., KAŠPÁREK, L., FRIDRICHOVÁ, R., MRKVIČKOVÁ, M., HORÁČEK, S., VYSKOČ, P. T.G.M. WRI studies focused on impacts of climate change on water cycle components and water resources. In Kovář, P., Máca, P., Ředinová, J. Water Policy 2009 - Water as a Vulnerable and Exhaustible Resource. Praha, 22. 6. 2009. ČZU Praha : Czech University of Life Sciences Prague, 2009, s. 119-123. ISBN 978-80-213-1944-8.

Novický, O., Kašpárek, L., Vyskoč, P. Integrated simulation by hydrological, hydraulic and water management modelling techniques in support of water resources management in the Czech Republic. In Taniguchi, M., Burnett, W.C., Fukushima, Y., Haigh From Headwaters to the Ocean. Kyoto (Japonsko), 1. 10. 2008. Leiden (NL) : CRC Press/Balkema, 2008, s. 243-248. ISBN 978-0-415-47279-1.

Novický, O., Vyskoč, P., Kašpárek, L., Fridrichová, R.,Treml, P. Assessment of possible impacts of climate change on water resources in the Vltava River basin. In Internationale Kommission zum Schutz der Elbe Magdeburger Gewässerschutzseminar 2008. Magdeburg (Německo), 7. 10. 2008. Magdeburg : Internationale Kommission zum Schutz der Elbe (IKSE), 2008, s. 164-168. ISBN .

Mičaník, T., Vyskoč, P., Prchalová, H., Polášek, M., Němejcová, D., Durčák, M., Richter, P. Surface Water Status Assessment for the Third Cycle River Basin Management Plan of the Czech Republic. VTEI – Vodohospodářské vědecko-technické informace, 2020, roč. 2020, č. 6, s. 4-18. ISSN 0322-8916.

Svobodová, J., Picek, J. Dokážete rozlišit raky v přírodě?. Rybářství, 2019, roč. 2019, č. 10, s. 12-15. ISSN 0373-675X.

Adam Beran, Martin Hanel, Magdalena Nesládková, Adam Vizina, Petr Vyskoč, Roman Kožín Climate change impacts on water balance in Western Bohemia and options for adaptation. Water Science and Technology: Water Supply, 2018, roč. 2018, č. , s. 323-335. ISSN 1606-9749.

Tušil, P., Richter, P., Vyskoč, P., Durčák, M., Filippi, R. Hodnocení stavu útvarů povrchových vod v České republice za období 2013-2015. VTEI , 2018, roč. 2018, č. 6, s. 26-33. ISSN 0322-8916.

Rosendorf, P., Vyskoč, P., Prchalová, H., Fiala, D. Estimated contribution of selected non-point pollution sources to the phosphorus and nitrogen loads in water bodies of the Vltava river basin. Soil and Water Research, 2016, roč. 11, č. 3, s. 196-204. ISSN 1801-5395.

Hrabánková, A., Picek, J. Nástroje pro hodnocení jakosti surové vody. Vodní hospodářství, 2014, roč. 64, č. 12, s. 13-17. ISSN 1211-0760.

Petr Vyskoč, Hana Prchalová, Tomáš Mičaník, Pavel Rosendorf, Alena Kristová, Jitka Svobodová Postupy hodnocení významnosti zdrojů a cest emisí znečišťujících látek do vody. Vodohospodářské technicko-ekonomické informace, 2014, roč. 56, č. 1, s. 2-7. ISSN 0322-8916.

Vyskoč, P., Prchalová, H., Mičaník, T., Rosendorf, P., Kristová, A., Svobodová, J. Postupy hodnocení významnosti zdrojů a cest emisí znečišťujících látek do vody. Vodohospodářské technicko-ekonomické informace, 2014, roč. 56, č. 1, s. 2-7. ISSN 0322-8916.

Svobodová J., Douda K., Štambergová M., Picek J., Vlach P., Fischer D. The relationship between water quality and indigenous and alien crayfish distribution in the Czech Republic: patterns and conservation implications. AQUATIC CONSERVATION: MARINE AND FRESHWATER ECOSYSTEMS, 2012, roč. 2012, č. 22, s. 776-786. ISSN 1099-0755.

Picek J., Vyskoč P., Rosendorf P., Svobodová J. Nástroje pro hodnocení množství a jakosti vod. Vodohospodářské technicko-ekonomické informace, 2011, roč. 53, č. 5, s. 15-19. ISSN 0322-8916.

Mičaník, T., Vyskoč, P., Richter, P., Filippi, R. První vyhodnocení jakosti povrchových vod z hlediska plnění norem environmentální kvality pro prioritní látky a některé další znečišťující látky podle novelizovaného nařízení vlády č. 61/2003 Sb.. VTEI - Vodohospodářské technicko-ekonomické informace, 2011, roč. 53, č. 3, s. 20-23. ISSN 0322-8916.

Svobodová, J., Štambergová, M., Vlach, P., Picek, J., Douda, K.,Beránková, M. Vliv jakosti vody na populace raků v České republice – porovnání s legislativou ČR. VTEI, příloha Vodního hospodářství č. 12/2008, 2008, roč. 50, č. 6, s. 1-5. ISSN 0322-8916.

Mičaník, T., Prchalová, H., Vyskoč, P., Fojtík, T. Vyhláška č. 44/2021 Sb. ze dne 1. 2. 2021, kterou se mění vyhláška č. 49/2011 Sb., o vymezení útvarů povrchových vod. . výsledky promítnuté do právních předpisů a norem: 44/2021 Sb. MŽP a MZe [CR, 2021]

Svobodová, J., Kozubíková Balcarová, E., Fischer, D., Vlach, P., Štambergová, M., Picek, J., Semerádová, S., Štruncová, E., Beránková, T. Metodika regulace a eradikace invazních druhů raků: výběr vhodných metod v závislosti na charakteru vodního útvaru. 2020, MŽP, Sekce ochrany přírody, 22. 12. 2020.

Metodika pro navrhování adaptačních opatření k eliminaci dopadů nedostatku vody. 2019, Ministerstvo zemědělství, 6. 3. 2019.

Hlušičková E., Makovcová M., Picek J., Beránková T., Ansorge L. Hodnoty CF AWARE pro výpočet vodní stopy pro odběry z veřejného vodovodu založené na datech ČHMÚ. 2018, , 1. 11. 2030.

Hlušičková E., Makovcová M., Picek J., Beránková T., Ansorge L. Hodnoty CF AWARE pro výpočet vodní stopy pro odběry z veřejného vodovodu založené na modelu BILAN. 2018, , 1. 11. 2030.

Hlušičková E., Makovcová M., Picek J., Beránková T., Ansorge L. Hodnoty CF AWARE pro výpočet vodní stopy pro vypouštění do veřejné kanalizace založené na datech ČHMÚ. 2018, , 1. 11. 2030.

Hlušičková E., Makovcová M., Picek J., Beránková T., Ansorge L. Hodnoty CF AWARE pro výpočet vodní stopy pro vypouštění do veřejné kanalizace založené na modelu BILAN. 2018, , 0. 0. 0000.

Hlušičková E., Makovcová M., Picek J., Beránková T., Ansorge L. Hodnoty CF FWUA pro výpočet vodní stopy pro odběry z veřejného vodovodu založené na datech ČHMÚ. 2018, , 0. 0. 0000.

Hlušičková E., Makovcová M., Picek J., Beránková T., Ansorge L. Hodnoty CF FWUA pro výpočet vodní stopy pro odběry z veřejného vodovodu založené na modelu BILAN. 2018, , 0. 0. 0000.

Hlušičková E., Makovcová M., Picek J., Beránková T., Ansorge L. Hodnoty CF FWUA pro výpočet vodní stopy pro vypouštění do veřejné kanalizace založené na datech ČHMÚ. 2018, , 0. 0. 0000.

Hlušičková E., Makovcová M., Picek J., Beránková T., Ansorge L. Hodnoty CF FWUA pro výpočet vodní stopy pro vypouštění do veřejné kanalizace založené na modelu BILAN. 2018, , 0. 0. 0000.

Ansorge L.; Dlabal J.; Prchalová H.; Vyskoč P.; Vološinová D.; Beránková T. . 2017, Ministerstvo životního prostředí, 13. 12. 2017.

Durčák, M., Opatřilová, L., Vyskoč, P., Richter, P., Tušil, P., Filippi, R., Rosendorf, P., Mičaník, T., Kristová, A., Prchalová, H., Musil, J. Metodika hodnocení chemického a ekologického stavu útvarů povrchových vod kategorie řeka pro druhý cyklus plánů povodí v ČR. 2014, , 1. 11. 2030.

Durčák, M., Tušil, P., Mičaník, T., Rosendorf, P., Kristová, A., Vyskoč, P. Metodika hodnocení chemického stavu útvarů povrchových vod tekoucích (kategorie řeka). 2014, SekcetechnickéochranyživotníhoprostředíMŽP,Vršovická1442/65,Praha10, 25. 4. 2014.

Petr Vyskoč, Hana Prchalová, Tomáš Mičaník, Pavel Rosendorf, Alena Kristová, Jitka Svobodová, Vít Kodeš Metodika hodnocení dopadu emisí na vodní prostředí. 2014, Odbor vodohospodářské politiky a protipovodňových opatření Ministerstva zemědělství ČR, Těšnov 17, Praha 1, ČR, 12. 12. 2014.

Durčák, M., Tušil, P., Mičaník, T., Rosendorf, P., Kristová, A., Vyskoč, P. Metodika hodnocení ekologického stavu útvarů povrchových vod tekoucích (kategorie řeka) – specifické znečišťující látky. 2014, SekcetechnickéochranyživotníhoprostředíMŽP,Vršovická1442/65,Praha10, 25. 4. 2014.

Rosendorf, P. Tušil, P., Durčák, M., Vyskoč, P., Svobodová, J., Beránková, T. Metodika hodnocení všeobecných fyzikálně–chemických složek ekologického stavu útvarů povrchových vod tekoucích. 2014, Ministerstvoživotníhoprostředí, 25. 4. 2014.

Hrabánková, A., Picek, J. Metodické postupy pro pořizování, zpracování a využívání dat o jakosti surové povrchové a podzemní vody. 2013, Ministerstvozemědělství, 27. 11. 2013.

Petr Vyskoč, Hana Prchalová, Pavel Rosendorf, Alena Kristová a kol. Metodické postupy pro hodnocení významnosti jednotlivých typů zdrojů znečištění s ohledem na aplikaci imisně-emisního přístupu v oblasti ochrany vod. 2012, MinisterstvoživotníhoprostředíČR,Vršovická65,10010Praha10, 25. 4. 2014.

Petr Vyskoč, Hana Prchalová, Pavel Rosendorf, Alena Kristová a kol. Metodické postupy pro hodnocení významnosti jednotlivých typů zdrojů znečištění s ohledem na aplikaci imisně-emisního přístupu v oblasti ochrany vod. 2012, , .

Petr Vyskoč, Hana Prchalová, Pavel Rosendorf, Alena Kristová a kol. Metodické postupy pro hodnocení významnosti jednotlivých typů zdrojů znečištění s ohledem na aplikaci imisně-emisního přístupu v oblasti ochrany vod. 2012, , .

Mičaník, T., Vyskoč, P., Filippi, R., Richter, P. Jakost povrchových vod z hledisla plnění požadavků nařízení vlády č. 61/2003 Sb., ve znění pozdějších předpisů, matrice \\\\\\\"voda\\\\\\\", období 2006-2008: Všeobecné ukazatele. 2011, MinisterstvoživotníhoprostředíČR,odborochranyvod,Vršovická1442/65Praha10,11010, 9. 12. 2011.

Mičaník, T., Vyskoč, P., Filippi, R., Richter, P. Jakost povrchových vod z hledisla plnění požadavků nařízení vlády č. 61/2003 Sb., ve znění pozdějších předpisů, matrice \\\\\\\\\\\\\\\"voda\\\\\\\\\\\\\\\", období 2006-2008: Další syntetické a nesyntetické znečišťující látky. 2011, MinisterstvoživotníhoprostředíČR,odborochranyvod,Vršovická1442/65Praha10,11010, 9. 12. 2011.

Mičaník, T., Vyskoč, P., Filippi, R., Richter, P. Jakost povrchových vod z hledisla plnění požadavků nařízení vlády č. 61/2003 Sb., ve znění pozdějších předpisů, matrice \\\\\\\\\\\\\\\"voda\\\\\\\\\\\\\\\", období 2006-2008: Ukazatele sloužící pro vyhodnocení chemického stavu ůtvarů. 2011, MinisterstvoživotníhoprostředíČR,odborochranyvod,Vršovická1442/65Praha10,11010, 9. 12. 2011.

Durčák, M., Tušil, P., Horký, P., Filippi, R., Vyskoč, P. Návrh monitorovací sítě biologických složek pro hodnocení stavu útvarů povrchových vod kategorie „řeka“. 2011, , 0. 0. 0000.

Durčák, M., Tušil, P., Filippi, R., Vyskoč, P. Návrh reprezentativních monitorovacích míst pro hodnocení stavu útvarů povrchových vod kategorie „řeka“. 2011, , 0. 0. 0000.

Mičaník, T., Vyskoč, P., Richter, P., Filippi, R. Vyhodnocení jakosti povrchových vod ČR - prioritní látky podle SR 2008/105/ES. 2010, MinisterstvoživotníhoprostředíČR,Odborochranyvod,Vršovická1442/65Praha10,10010, 9. 12. 2010.

Vyskoč, P., Zeman, V. Metodický postup zpracování vodohospodářské bilance současného a výhledového stavu množství povrchových vod. 2008, OOVMŽP, 20. 11. 2008.

Picek, J., Rosendorf, P., Fiala, D. Simulační model šíření a transformace rizikových látek - PPCP - VSTOOLS.SIRIL-PPCP. 2021. VÚV TGM, v. v. i., Česká republika.

Picek, J., Rosendorf, P. Hodnocení eutrofizačního potenciálu zdrojů znečištění - podrobný model - VSTOOLS.EUTRO-FOCUS. 2020. VÚV TGM, v. v. i., Česká republika.

Svobodová, J., Picek, J., Semerádová, S., Beneš, J., Schneider, M., Pazderník, J. Raci v ČR - aplikace pro podporu rozhodování při ochraně našich původních raků a ryb. 2020. VÚV TGM, v. v. i., Česká republika.

Picek, J., Svobodová, J., Semerádová, S., Beneš, J. Raci v ČR. 2019. VÚV TGM, v. v. i., Česká republika.

Picek, J., Vyskoč, P., Filippi, R., Semerádová, S. Vyhodnocení dostupnosti vodních zdrojů - VSTOOLS.DOVOZ. 2018. VÚV TGM, v.v.i., Česká republika.

Ansorge L., Picek J. Aplikace pro sestavení a ověření vodní stopy v souladu s mezinárodními standardy. 2017. Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka, v.v.i., Podbabská 2582/30, 160 00 Praha 6, Česká republika.

Ansorge L., Picek J. Aplikace pro modelování dopadů socio-ekonomických změn ve společnosti na spotřebu vody. 2015. Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka, v.v.i., Podbabská 2582/30, 160 00 Praha 6, Česká republika.

Picek, J., Rosendorf, P., Ansorge, L. Systém pro podporu rozhodování (DSS) při optimalizaci návrhu opatření v povodí vodních nádrží - VSTOOLS.EUTRO. 2015. Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka, v.v.i., Česká republika.

Petr Vyskoč, Jiří Picek, Renata Filippi, Silvie Semerádová Programové vybavení pro hodnocení dopadu emisí na vodní prostředí. 2014. Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka, v.v.i., Podbabská 2582/30, 160 00 Praha 6, Česká republika.

Picek, J., Hrabánková, A., Dlabal, J. Internetový portál - Jakost surové vody. 2013. VÚV TGM, v.v.i., Česká republika.

Vyskoč, P., Richter, P., Mičaník, T., Filippi, R. Internetový portál pro publikaci výsledků vyhodnocení jakosti povrchových vod v profilech sledování. VÚV TGM, v.v.i., 2011.. 2011. VÚV TGM, v.v.i., Česká republika.

Vyskoč, P., Picek, J., Semerádová, S. Internetový portál - Informační podpora stanovování emisních limitů kombinovaným způsobem. 2010. VÚV T.G.M., v.v.i., Česká republika.

Vyskoč, P., Picek, J., Semerádová, S. Aplikace pro stanovení emisních limitů kombinovaným způsobem. 2009. VÚV T.G.M., v.v.i., Česká republika.

Picek, J., Vyskoč, P., Rosendorf, P. Simulační model vodohospodářské bilance jakosti povrchových vod. 2009. VÚV T.G.M., v.v.i., Česká republika.

PICEK, J., VYSKOČ, P. PRGAGREG - Nástroje pro analýzy říční sítě a objektů na říční síti. 2008. VÚV T.G.M., v.v.i., Česká republika.

PICEK, J., SVOBODOVÁ, J. PRGANJAK - Analýzy sítí profilů a ukazatelů na vodních tocích. 2008. VÚV T.G.M., v.v.i., Česká republika.

PICEK, J., VYSKOC, P. PRGSIMUL - Vodohospodářská bilance množství povrchových vod, simulační výpočty. 2008. VÚV T.G.M., v.v.i., Česká republika.

PICEK, J., VYSKOČ, P. PRGSTATG - Statistické vyhodnocení a grafy vodohospodářských dat. 2008. VÚV T.G.M., v.v.i., Česká republika.

Picek, J., Vyskoč, P., Zeman, V Simulační model množství povrchových vod: zásobní funkce vodohospodářské soustavy. 2008. VÚV T.G.M., v.v.i., Česká republika.

PICEK, J., VYSKOC, P. UI - Univerzální správce úloh, řízení výpočtů a editace dat. 2008. VÚV T.G.M., v.v.i., Česká republika.

Pavel Kožený, Tereza Beránková, Eduard Bouše, Daniel Fiala, Hana Janovská, Jiří Musil, Jiří Picek, Jitka Svobodová Využití umělých a přírodních struktur pro revitalizace a zvýšení biologické a morfologické pestrosti pražských potoků. Výzkumná zpráva. Praha : Hlavní město Praha , 2018, 43 s.

Ansorge L., Dlabal J., Hlušičková E., Makovcová M., Picek J. Výzkum metod a regionalizace charakterizačních faktorů užívaných při LCA water scarcity / availability footprint studiích pro různé typy vodních zdrojů. Výzkumná zpráva. Praha : , 2018, 25 s.

Dlabal, J., Picek, J., Dzuráková, M., Rozkošný, M. Webová prezentace projektu Neinvazivní a šetrné postupy řešení kvality prostředí a údržby vodních prvků v rámci památkové péče [on-line]. VÚV TGM, v.v.i., 2021, 30. 10. 2020
https://heis.vuv.cz/data/webmap/datovesady/projekty/vodniprvky/default.asp?

Dlabal, J., Picek, J., Dzuráková, M., Rozkošný, M., Pavelková, R., David, V. Hodnocení území na bývalých rybničních soustavách (vodních plochách) s cílem posílení udržitelného hospodaření s vodními a půdními zdroji v ČR - interaktivní aplikace [on-line]. , 2015, 30. 1. 2014
http://heis.vuv.cz/data/webmap/datovesady/projekty/HistorickeRybniky/default.asp

Dopady atmosférické depozice na vodní prostředí.

Svobodová, J., Picek, J., Svobodová, E Lze zastavit invazi nepůvodních raků?.

Svobodová, J., Picek, J. Mobilní aplikace RACI V ČR pomůže chránit naše raky.

Semerádová, S. Rámcová směrnice o vodách – zprávy podávané Evropské komisi jako komplexní zdroj informací o životním prostředí a našem přístupu k němu. .

Mlejnková, H., Sovová, K., Picek, J., Dlabal, J., Richter, P. Databáze zdrojů vodohospodářských informací.

Vyskoč, P, Prchalová, H., Rosendor, P. et al. An Inventory of Emission Sources and Pathways and a Quantification of Emission Load in the Czech Republic.

Balvín, Picek Studie možnosti posílení retenčních účinků VD Nechranice.

Vyskoč, P., Beneš, J., Prchalová, H., Rosendorf, P., Kristová, A., Mičaník, T., Svobodová, J., Semerádová, S., Richter, P., Matoušová, L. Stanovení podílu emisí znečišťujících látek z různých zdrojů do povrchových vod.

Tušil, P., Ansorge, L., Drbal, K., Durčák, M., Kult, A., Mičaník, T., Prchalová, H., Rosendorf, P., Šajer, J., Vyskoč, P. Návrh činností souvisejících s naplňováním požadavků příslušných směrnic EU a národních právních předpisů v rámci 2.plánovacího cyklu v oblasti vod v období 2011-2016.

Tušil, P., Rieder, M., Durčák, M., Fuksa, J.K., Prachalová, H., Vyskoč, P., Rosendorf, P., Mičaník, T., Němejcová, D, Syrovátka, V., Kokeš, J. SWOT analýza systémů vymezení útvarů povrchových vod tekoucích.

Novický, O., Fridrichová R., Cihlář, J., Vyskoč, P. Hodnocení vodních zdrojů v podmínkách klimatické změny – výsledky dosavadních studií.

Vizina, A., Novický, O.,Treml, P., Vyskoč, P. Climate change and water management planning in the Czech Republic.

Vizina, A., Vyskoč, P., Kašpárek, L., Novický, O., Zeman, V., Picek, J., Cihlář, J., Koterová, V., Hála, R., Průšová, K., Leníček, J. Výhledová studie potřeb a zdrojů vody v Karlovar. kraji - Etapa II.1-Posouzení výhledového stavu.

Petr Vyskoč, Hana Prchalová, Tomáš Mičaník, Pavel Rosendorf, Alena Kristová, Jitka Svobodová Workshop k problematice hodnocení dopadu emisí na vodní prostředí. Praha, Česká republika. 16. 4. 2014 - 16. 4. 2014

Petr Vyskoč, Jiří Picek, Renata Filippi Workshop k problematice využití programové vybavení pro hodnocení dopadu emisí na vodní prostředí. Praha, Česká republika. 17. 12. 2014 - 17. 12. 2014