Department of Aquatic Organisms Ecology
- Head of the Department: Ing. Jiří Musil, Ph.D.
- Phone: +420 220 197 542
- E-mail: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
The Department deals with the identification and assessment of anthropogenic effects, the study of their impacts on aquatic ecosystems and the design, development and evaluation of corrective actions to mitigate the impact of various civilization factors. It also focuses on the issue of non-native and invasive species in aquatic ecosystems and the environmental risks associated with the operation of hydropower plants.
- Department Activities
- Staff of Department
- Publishing
- Results of Applied Research
- Other Research Results
- International Cooperation
Department Activities
Department Activities
- Identification and assessment of anthropogenic effects and study of their impacts (river network fragmentation, hydropower, hydromorphological changes, minimum residual flows, effects of fishing and aquaculture, climate change, biological invasion) on aquatic ecosystems,
- the issue of non-native and invasive species in aquatic ecosystems (detection, transport vectors, proliferation, ecological and economic consequences of invasions, management and eradication measures),
- environmental risks associated with the operation of hydroelectric power plants (model species: River Eel (Anguilla anguilla)),
- proposals, development and evaluation of corrective measures to mitigate the impact of civilization factors (fish transitions, revitalization of river micro-habitats and meso-habitats, etc.),
- monitoring and study of fish communities (determination of abundance and age structure, reproductive potential, nutritional biology, morphology),
- mapping the occurrence of European-important species of fish and lemons (Natura 2000) and their sustainable management,
- studying migration behavior and assessing migratory success/potential of fish,
- development of fish migration automatic monitoring systems.
Staff of Department
Staff of Department
| Name and Surname | Telephone | |
|---|---|---|
| Ing. Miroslav Barankiewicz | 220 197 422 | This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. |
| Mgr. Eduard Bouše | 220 197 526 | This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. |
| RNDr. Tomáš Daněk, Ph.D. | 220 197 417 | This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. |
| Ing. Jiří Musil, Ph.D. | 220 197 542 | This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. |
| Patrik Slanina | 220 197 278 | This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. |
Publishing
Publishing 2008–2024
Kapitola v knize
Just Tomáš a Barankiewicz Miroslav Ekologická obnova v České republice II. Ivana Jongepierová, Pavel Pešout a Karel Prach (ed.) Praha: Agentura ochrany přírody a krajiny České republiky 2018. [Kap] Přírodě blízká protipovodňová úprava Blanice ve Vlašimi, 152-156. ISBN 978-80-88076-83-4.
Musil, J. Zpráva o naplňování Cíle 2010 v ochraně biodiverzity v ČR. Zedek V, Hošek M, Vavřinová J, Sukeníková K (ed.) Praha, Česká republika: Ministerstvo životního prostředí České republiky 2010. [Kap] Celistvost ekosystémů a ekosystémové služby – 13. fragmentace říčních systémů, 46-50. ISBN 978-80-7212-554-8.
Kestemont P., Rougeot, C., Musil J., Toner, D. Farming of Eurasian Perch, Volume 1: Juvenile Production. D. Toner, C. Rougeot (ed.) Dublin: Aquaculture Development Division 2008. [Kap] Larval and Juvenile Production, 30-41. ISBN .
Článek ve sborníku
Bouše E., Barankiewicz M., Vlašánek P., Musil J. Revitalization potential of groyne fields on the lower part Labe of the Czech Republic. In Magdeburský seminář o ochraně vod 2021. Online, 7. 10. 2021. : Mezinárodní komise pro ochranu Labe (MKOL) - sekretariát, 2021, s. 127. ISBN .
Bouše, E., Barankiewicz, M., Vlašánek, P.,Veselý, D., Musil, J. Vliv revitalizace dolního toku Dyje na rybí společenstvo. In Michaela Holubová, Petr Blabolil XVII. Rybářská a ichtyologická konference. Vodňany, 4. 11. 2020. Vodňany : L - Biologické centrum AV ČR, v.v.i., 2020, s. 1-1. ISBN 978-80-86668-65-9.
Eduard Bouše, Miroslav Barankiewicz, Tereza Čechová, Pavel Kožený, Tereza Beránková, Hana Janovská Habitatové preference ryb v revitalizovaných pražských potocích. In Karla Štiková Říční krajina 12 se zaměřením na problematiku řek a okolní krajiny. Praha, 5. 11. 2018. : , 2018, s. 8-13. ISSN Není.
Barteková T., Musil J. Migrační úspěšnost a průběh katadromní migrace úhoře říčního (Anguilla anguilla, L.) v povodí řeky Odry na území České republiky. In . Wroclav, 28. 11. 2018. : , 2018, s. . ISBN .
Eduard Bouše, Miroslav Barankiewicz, David Štrunc Vliv říčních výhonů na složení ichtyofauny - vyhodnocení revitalizačních opatření na dolním toku Labe. In Doc. Ing. Radovan Kopp, Ph.D.; Ing. Jan Grmela, Ph.D. Sborník příspěvků z konference RYBIKON 2018. Mendelova univerzita v Brně, 10. 10. 2018. Brno : Vydavatelství Mendelovy univerzity v Brně, 2018, s. 39. ISBN 978-80-7509-572-5.
Barankiewicz, M., Musil, J. Výskyt krevnatky úhoří (Anguillicoloides crassus) u finálního hostitele úhoře říčního (Anguilla anguilla) na vybraných lokalitách ČR . In Jan Kouřil, Peter Podhorec, Zuzana Dvořáková 14. Česká rybářská a ichtyologická konference. Vodňany, 3. 10. 2014. Vodňany : Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Fakulta rybářství a ochrany vod, Zátiší 728/II, 389 25 Vodňany, 2014, s. 34-35. ISBN 978-80-7514-006-7.
Musil J., Drozd, B., Bláha M., Gallardo J.M. Diverzita ichtyofauny aluviální oblasti řeky Lužnice v CHKO Třeboňsko (obec Majdaléna).. In Štěpán Kubík & Miroslav Barták Proceedings of the „Workshop on biodiversity”, Jevany. Jevany, 2. 7. 2013. Jevany : CZU v Praze, 2013, s. 265-270. ISBN 978-80-213-2423-7.
Vajglová, T., Jiří Musil, Miroslav Barankiewicz, Joao de Medeiros Camara Cavaliero Ferrao, Milan Hladík Migrační úspěšnost úhoře říčního (Anguilla anguilla L.) během katadromní migrace v říční síti České republiky: prvotní výsledky v roce 2012. In Štěpán Kubík & Miroslav Barták Proceedings of the „Workshop on biodiversity”, Jevany. Jevany, 2. 7. 2013. Praha : ČZU v Praze, 2013, s. 407-414. ISBN 978-80-213-2423-7.
Barankiewicz M, Musil J, Koščo J Morfologická variabilita hlavačkovce Glenova (Perccottus glenii) na Jihovýchodním Slovensku. In Štěpán Kubík & Miroslav Barták Proceedings of the „Workshop on biodiversity”, Jevany. Jevany, 2. 7. 2013. Praha : ČZU v Praze, 2013, s. 7-14. ISBN 978-80-213-2423-7.
Barankiewicz M, Musil J, Vajglová T Výskyt krevnatky úhoří (Anguillicoloides crassus) u úhoře říčního (Anguilla anguilla) na vybraných lokalitách říční sítě České republiky. In Štěpán Kubík & Miroslav Barták Proceedings of the „Workshop on biodiversity”, Jevany. Jevany, 2. 7. 2013. Praha : ČZU v Praze, 2013, s. 15-20. ISBN 978-80-213-2423-7.
Musil, J., Horký, P., Slavík, O. Native fish species richness explains the number of established alien fish in freshwaters. In J. Kollman, T. Mölken, HP. Ravn Biological Invasions in a Changing World – from Science to Management. University of Copenhagen, Denmark, 14. 9. 2010. Copenhagen, Denmark : University of Copenhagen, Denmark, 2010, s. 225-225. ISBN 978-87-993976-0-0.
Musil, J., Horký, P., Kulíšková, P., Slavík, O., Jurajda, P. River connectivity as the predictor of reproduction success in 0+ communities.. In Cowx I.G. et al. Improving the ecological status of fish communities in inland waters. Hull, Anglie, 31. 3. 2009. Hull International Fisheries Institute (HIFI), t : Hull International Fisheries Institute (HIFI), the University of Hull,Anglie, 2009, s. 36-36. ISBN .
Musil, J., Peterka, J. Production of large pikeperch (Sander lucioperca) juveniles: Alternative use of an Asian alien fish, Pseudorasbora parva.. In Gherardi F., Aquiloni L. Managing Alien Species for Sustainable Development of Aquaculture and Fisheries. Florence, Italy, 5. 11. 2008. Florence, Italy : University of Florence, Department of Evolutionary Biology, 2008, s. 97-98. ISSN N.
Musil, J., Jurajda, P., Adámek, Z., Slavík, O. Review of non-native freshwater fishes in the Czech Republic: History, present, and future perspectives.. In Gherardi F., Aquiloni L. Managing Alien Species for Sustainable Development of Aquaculture and Fisheries. Florence, Italy, 5. 12. 2008. Florence, Italy : University of Florence, Department of Evolutionary Biology, 2008, s. 51-52. ISSN N.
Článek v odborném periodiku
Gozlan R.E., Záhorská E., Cherif E., Asaeda T., Britton J.R., Chang CH., Hong T., Miranda R., Musil J., Povz M., Tarkan A.S., Tricarico E., Trichkova T., Verreycken H., Weiperth A., Witkowski A., Zamora L., Zweimueller I., Zhao Y., Esmaeili H., Combe M. Native drivers of fish life history traits are lost during the invasion process . Ecology and Evolution, 2020, roč. 10, č. 16, s. 8623-8633. ISSN 2045-7758.
Vrána P., Musil J. Po stopách úhoře říčního (2): Na cestě. Rybářství , 2019, roč. 2019, č. 6, s. 42-44. ISSN 0373-675X.
Vrána P., Musil J. Po stopách úhoře říčního (3): Zločin a trest. Rybářství , 2019, roč. 2019, č. 7, s. 52-54. ISSN 0373-675X.
Tereza Barteková, Jiří Musil, Po stopách úhoře říčního (5) – Moderní monitorovací technologie pomáhají k novým poznatkům o migračním chování úhořů. Rybářství, 2019, roč. 2019, č. 9, s. 57-59. ISSN 0373-675.
Tereza Barteková, Jiří Musil Po stopách úhoře říčního (6) – Migrační úspěšnost úhoře během reprodukční katadromní migrace. Rybářství, 2019, roč. 2019, č. 10, s. 19-21. ISSN 0373-675.
Musil J, Vrána P., Barteková T Po stopách úhoře říčního (7): Ochrana a obnova populace. Rybářství , 2019, roč. 2019, č. 11, s. 20-22. ISSN 0373-675X.
Daněk, T., Musil, J., Vlašánek, P., Svobodová, J., Barteková, T., Štrunc, D., Barankiewicz, M., Bouše, E., Svobodová, E., Johnsen, S. I., Andersen, O. Movement patterns of juvenile and adult noble crayfish (Astacus astacus) in a small stream, determined by radiotelemetry. ANNALES DE LIMNOLOGIE-INTERNATIONAL JOURNAL OF LIMNOLOGY , 2019, roč. 2019, č. 55/19, s. 1–6. ISSN 0003-4088.
Marek P., Musil J. Masarykovo zdymadlo Střekov – migrační bariéra i po roce 2020?. Ochrana přírody, 2018, roč. 73, č. 4, s. 10-13. ISSN 1210-258X.
Barteková T., Musil J., Vogl Z., Vrána P., Kaplan A. Světový den migrace ryb aneb kam putují ryby?. Vodohospodářské technicko-ekonomické informace, 2018, roč. 60, č. 4, s. 44-45. ISSN 0322-8916.
Hajdú J., Musil J., Krajč T., Barteková T., Štencl R., Saxa A., Záhorec L. Telemetrický monitoring hlavátky podunajskej na strednom toku Hrona. Chránené územia Slovenska, 2018, roč. 91, č. 2018, s. 21-23. ISSN 2453-6423.
Daněk, T., Musil, J., Vlašánek, P., Svobodová, J., Johnsen, S. I., Barteková, T., Štrunc, D., Barankiewicz, M., Bouše, E., Andersen, O. Telemetry of co-occurring noble crayfish (Astacus astacus) and stone crayfish (Austropotamobius torrentium): diel changes in movement and local activity. Fundamental and Applied Limnology, 2018, roč. 2018, č. 191/4, s. 339-352. ISSN 1863-9135.
Hladík M., Škuta S., Zbořil A., Musil J. Evidence příčných staveb na vodních tocích v rámci Databáze migračních překážek (DAMIR). Vodní Hospodářství, 2017, roč. 2017, č. 11, s. 1-4. ISSN 6319 .
Kalous L., Musil, J., Petrtýl M., Vajglová, T., Romočuský, Š., Bušta, L. The danger in the anglers’ bucket: qualitative and quantitative insight. Acta Societatis Zoologicae Bohemicae, 2013, roč. 77, č. X, s. 25-33. ISSN 1211-376X.
Bláha, M., Šetlíková, I., Musil J., Policar, T. No reason for keeping 0+ perch (Perca fluviatilis L.) with the prey fish. Aquaculture International, 2013, roč. 21, č. 4, s. 883-896. ISSN 0967-6120.
Musil J., Horký P., Slavík O., Zbořil A., Horká P. The response of the young of the year fish to river obstacles: Functional and numerical linkages between dams, weirs, fish habitat guilds and biotic integrity across large spatial scale. Ecological Indicators, 2012, roč. 2012, č. 23, s. 634-640. ISSN 1470-160X.
Musil, J., Jurajda, P., Adámek, Z., Horký, P., Slavík, O. Non-native fish introductions in the Czech Republic - species inventory, facts and future perspectives. Journal of Applied Ichthyology, 2010, roč. 26, č. 2, s. 38-45. ISSN 0175-8659.
Gozlan R.E., Andreou D., Asaeda T., Beyer K., Bouhadad R., Burnard D., Caiola N., Cakic P., Djikanovic V., Esmaeili H.R., Falka I., Golicher D., Harka A., Jeney G., Kováč V., Musil J. a kol. Pan-continental invasion of Pseudorasbora parva: towards a better understanding of freshwater fish invasions. Fish and Fisheries, 2010, roč. 11, č. 4, s. 315-340. ISSN 1467-2960.
Stejskal V., Kouřil J., Musil J., Hamáčková J., Policar T. Growth pattern of all-female perch (Perca fluviatilis L.) juveniles - is monosex perch culture beneficial?. JOURNAL OF APPLIED ICHTHYOLOGY, 2009, roč. 25, č. 4, s. 432-437. ISSN 0175-8659.
Musil, J., Drozd, B., Bláha, M., Gallardo, J. M., Randák, T. First records of the black bullhead, Ameiurus melas (Rafinesque, 1820) in the Czech Republic freshwaters. Cybium, 2008, roč. 32, č. 4, s. 352-354. ISSN 0399-0974.
Results of Applied Research
Results of Applied Research 2008–2024
Výsledky s právní ochranou (užitný vzor, průmyslový vzor)
Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka, v.v.i. Testování modelových typů revitalizačních opatření. Původce vzoru: Bouše E., Hlom J., Procházka J., Barteková T., Vlašánek P., Musil J., Balvín P.. Int. 34921. Úřad průmyslového vlastnictví.
Poskytovatelem realizované výsledky (výsledky promítnuté do právních předpisů a norem, do směrnic a předpisů nelegislativní povahy závazných v rámci kompetence příslušeného poskytovatele)
Birklen P, Marek P, Musil J Koncepce zprůchodnění říční sítě ČR - aktualizace. výsledky promítnuté do právních předpisů a norem: MŽP ČR [CR, 2014]
Certifikované metodiky, léčebné nebo památkové postupy, specializované mapy s odborným obsahem
Štrunc D., Rosendorf, P., Svobodová, J., Musil, J. METODIKA MONITORINGU ZDROJŮ ZNEČIŠTĚNÍ POVRCHOVÝCH VOD POMOCÍ PEVNÉ MATRICE RYBY. 2019, Ministerstvo životního prostředí, Vršovická 1442/65; Praha 10, Vršovice; 100 10 Praha 10, Sekce technické ochrany životního prostředí přírody,odbor ochrany vod, CM/2018/TD03000458/2, 4. 2. 2019.
Musil, J., Štrunc, D. ÚČELOVÝ RYBÁŘSKÝ MANAGEMENT NA VODÁCH ZATÍŽENÝCH POLUTANTY. 2018, Ministerstvo zemědělství ČR, Těšnov 65/17, 11000 Praha 1., Sekce lesního hospodářství, Odbor státní správy lesů, myslivosti a rybářství, 14. 12. 2018.
Durčák, M., Opatřilová, L., Vyskoč, P., Richter, P., Tušil, P., Filippi, R., Rosendorf, P., Mičaník, T., Kristová, A., Prchalová, H., Musil, J. Metodika hodnocení chemického a ekologického stavu útvarů povrchových vod kategorie řeka pro druhý cyklus plánů povodí v ČR. 2014, , 1. 11. 2030.
Musil J, Kalous L, Vajglová T, Petrtýl M. Rekreační rybářství a vodní ekosystémy v České republice: principy vedoucí k trvalé udržitelnosti. 2014, Ministerstvo zemědělství České republiky , 19. 8. 2014.
Musil J., Vajglová T. Metodika pro monitoring katadromní migrace úhoře říčního. 2013, , 0. 0. 0000.
Software
Šindlar, Miloslav; Zapletal, Jan; Šindlarová, Tereza; Sucharda, Martin; Kožený, Pavel; Opatřilová, Libuše;Musil, Jiří; Bouše, Eduard; Janovská, Hana Softwarový nástroj pro hodnocení hydromorfologie vodních ekosystémů a navrhovaných opatření ve vazbě na biologické složky. Freeware verze webového rozhraní. 2017. Šindlar, s.r.o.; Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka, veřejná výzkumná instituce, Česká republika.
Šindlar, Miloslav; Zapletal, Jan; Šindlarová, Tereza; Sucharda, Martin; Kožený, Pavel; Opatřilová, Libuše;Musil, Jiří; Bouše, Eduard; Janovská, Hana Softwarový nástroj pro hodnocení hydromorfologie vodních ekosystémů a navrhovaných opatření ve vazbě na biologické složky. Modul v prostření ArcGIS Tools. 2017. Šindlar, s.r.o.; Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka, veřejná výzkumná instituce, Česká republika.
Výzkumná zpráva obsahující utajované informace, souhrnná výzkumná zpráva
Bouše E., Hlom J., Procházka J., Barteková T., Vlašánek P., Musil J., Balvín P. Testování modelových typů revitalizačních opatření. Výzkumná zpráva. Praha : Technologická agentura České republiky, 2021, 58 s.
Bouše E., Kladivová V., Kladivová A., Kožený P., Horáčková J., Krásenský P., Kerouš K. Zlepšení plavebních podmínek na Labi v úseku Ústí nad Labem - státní hranice ČR/SRN - Plavební stupeň Děčín. Hydraulický, hydromorfologický a biologický průzkum změn experimentálních opatření. C) Biologický průzkum experimentálních výhonů. . Výzkumná zpráva. Praha : Ředitelství vodních cest ČR, 2021, 128 s.
Eduard Bouše, Věra Kladivová, Pavel Kožený, Jiří Musil Hydraulický, hydromorfologický a biologický průzkum změn experimentálních výhonů v roce 2019 - C) Biologický průzkum experimentálních výhonů. Výzkumná zpráva. Praha : Ředitelství vodních cest ČR, 2020, 95 s.
Eduard Bouše, Věra Kladivová, Pavel Kožený Hydraulický, hydromorfologický a biologický průzkum změn experimentálních opatření v roce 2018 - Biologický průzkum bočního ramene Labe - Loubí. Výzkumná zpráva. Praha : Ředitelství vodních cest ČR, 2019, 62 s.
Eduard Bouše, Věra Kladivová, Pavel Kožený, Jitka Horáčková, Pavel Krásenský Hydraulický, hydromorfologický a biologický průzkum změn experimentálních opatření v roce 2018 - Biologický průzkum experimentálních výhonů. Výzkumná zpráva. Praha : Ředitelství vodních cest ČR, 2019, 86 s.
Eduard Bouše Využití umělých a přírodních struktur pro revitalizace a zvýšení biologické a morfologické pestrosti pražských potoků – Ichtyologický průzkum. Výzkumná zpráva. Praha : Magistrát hlavního města Prahy, 2019, 21 s.
Musil J., Barteková T., Barankiewicz M. Studie migrační prostupnosti příčné překážky Lovosice – Píštany. Výzkumná zpráva. : Agentura ochrany přírody a krajiny České republiky , 2018, 19 s.
Musil J., Barteková T., Štrunc D. Study on the state of eel escapement outside the territory of the Czech Republic. Výzkumná zpráva. : Ministerstvo zemědělství České republiky , 2018, 19 s.
Pavel Kožený, Tereza Beránková, Eduard Bouše, Daniel Fiala, Hana Janovská, Jiří Musil, Jiří Picek, Jitka Svobodová Využití umělých a přírodních struktur pro revitalizace a zvýšení biologické a morfologické pestrosti pražských potoků. Výzkumná zpráva. Praha : Hlavní město Praha , 2018, 43 s.
Other Research Results
Other Research Results 2008–2024
Uspořádání (zorganizování) konference
Hladík M., Vait J., Holub M., Musil J. Seminář k zprůchodnění migračních překážek ve vodních tocích. Holečkova 3178/8, 15000 Praha 5, Česká republika. 1. 11. 2018 - 1. 11. 2018
Musil J., Marek P., Dušek M. Vytvoření strategie pro snížení dopadů fragmentace říční sítě - závěrečný seminář/workshop . Povodí Vltavy, Holečkova 3178/8 Praha Smíchov , Česká republika. 25. 4. 2017 - 25. 4. 2017
Ostatní výsledky
Kožený, Pavel; Janovská, Hana; Opatřilová, Libuše; Bouše, Eduard; Beránková, Tereza Perspektivní hydromorfologické fenomény z hlediska zlepšování ekologického stavu vodních toků.
Musil J., Trýzna M., Barankiewicz M. Zprávy z monitoringu: Losos obecný na území Národní parku České Švýcarsko.
Musil J., Trýzna M. Monitoring lososa obecného (Salmo salar) na území České republiky.
Birklen, P., Dobrovský, P., Slavíková, A., Horecký, J., Musil, J., Marek, P. Řešení migrační prostupnosti říční sítě v ČR.
